Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AgrnA2ASQ1 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms