Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc163A2AGD7 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179.1 ms