Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6268A2A3U9 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6268A2A3U9 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6268A2A3U9 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6268A2A3U9 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6268A2A3U9 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6268A2A3U9 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6268A2A3U9 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6268A2A3U9 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6268A2A3U9 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6268A2A3U9 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6268A2A3U9 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6268A2A3U9 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6268A2A3U9 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6268A2A3U9 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6268A2A3U9 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6268A2A3U9 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6268A2A3U9 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6268A2A3U9 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6268A2A3U9 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6268A2A3U9 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6268A2A3U9 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6268A2A3U9 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6268A2A3U9 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm6268A2A3U9 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6268A2A3U9 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6268A2A3U9 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6268A2A3U9 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm6268A2A3U9 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm6268A2A3U9 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6268A2A3U9 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm6268A2A3U9 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6268A2A3U9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6268A2A3U9 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6268A2A3U9 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6268A2A3U9 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Gm6268A2A3U9 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Gm6268A2A3U9 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Gm6268A2A3U9 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6268A2A3U9 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6268A2A3U9 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.9 ms