Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Hdac6Q9Z2V5 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Hdac6Q9Z2V5 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Hdac6Q9Z2V5 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Hdac6Q9Z2V5 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Hdac6Q9Z2V5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Hdac6Q9Z2V5 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Hdac6Q9Z2V5 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Hdac6Q9Z2V5 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hdac6Q9Z2V5 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hdac6Q9Z2V5 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hdac6Q9Z2V5 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hdac6Q9Z2V5 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hdac6Q9Z2V5 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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