Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec2Q9WV35 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec2Q9WV35 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec2Q9WV35 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec2Q9WV35 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec2Q9WV35 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec2Q9WV35 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec2Q9WV35 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec2Q9WV35 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec2Q9WV35 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apobec2Q9WV35 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Apobec2Q9WV35 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Apobec2Q9WV35 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Apobec2Q9WV35 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
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Apobec2Q9WV35 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Apobec2Q9WV35 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Apobec2Q9WV35 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Apobec2Q9WV35 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Apobec2Q9WV35 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Apobec2Q9WV35 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms