Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phtf1Q9QZ09 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phtf1Q9QZ09 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Phtf1Q9QZ09 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Phtf1Q9QZ09 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phtf1Q9QZ09 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Phtf1Q9QZ09 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Phtf1Q9QZ09 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phtf1Q9QZ09 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phtf1Q9QZ09 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phtf1Q9QZ09 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phtf1Q9QZ09 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phtf1Q9QZ09 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phtf1Q9QZ09 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phtf1Q9QZ09 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phtf1Q9QZ09 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Phtf1Q9QZ09 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Phtf1Q9QZ09 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phtf1Q9QZ09 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms