Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms