Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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Hmg20aQ9DC33 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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Hmg20aQ9DC33 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Hmg20aQ9DC33 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Hmg20aQ9DC33 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Hmg20aQ9DC33 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Hmg20aQ9DC33 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Hmg20aQ9DC33 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Hmg20aQ9DC33 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Hmg20aQ9DC33 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Hmg20aQ9DC33 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Hmg20aQ9DC33 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hmg20aQ9DC33 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Hmg20aQ9DC33 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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