Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Smg9Q9DB90 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Smg9Q9DB90 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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