Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atg7Q9D906 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms