Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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