Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ccdc7Q9D541 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Ccdc7Q9D541 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ccdc7Q9D541 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ccdc7Q9D541 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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