Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V6

Tomm20l, TOMM20-like protein 1, mousemouse

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Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20lQ9D4V6 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tomm20lQ9D4V6 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms