Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Snx29Q9D3S3 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Snx29Q9D3S3 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Snx29Q9D3S3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Snx29Q9D3S3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Snx29Q9D3S3 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Snx29Q9D3S3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Snx29Q9D3S3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Snx29Q9D3S3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx29Q9D3S3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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