Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Krt20Q9D312 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Krt20Q9D312 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Krt20Q9D312 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Krt20Q9D312 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms