Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Chmp3Q9CQ10 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Chmp3Q9CQ10 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Chmp3Q9CQ10 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Chmp3Q9CQ10 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Chmp3Q9CQ10 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Chmp3Q9CQ10 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Chmp3Q9CQ10 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Chmp3Q9CQ10 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Chmp3Q9CQ10 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Chmp3Q9CQ10 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp3Q9CQ10 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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