Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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