Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tdrd1Q99MV1 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms