Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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Ddb2Q99J79 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Ddb2Q99J79 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Ddb2Q99J79 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Ddb2Q99J79 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ddb2Q99J79 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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