Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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