Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc8Q8VD72 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Ttc8Q8VD72 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Ttc8Q8VD72 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc8Q8VD72 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms