Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
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Vmn1r72Q8K3N7 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Vmn1r72Q8K3N7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Vmn1r72Q8K3N7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Vmn1r72Q8K3N7 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Vmn1r72Q8K3N7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Vmn1r72Q8K3N7 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vmn1r72Q8K3N7 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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