Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Hpf1Q8CFE2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Hpf1Q8CFE2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Hpf1Q8CFE2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Hpf1Q8CFE2 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Hpf1Q8CFE2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Hpf1Q8CFE2 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Hpf1Q8CFE2 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Hpf1Q8CFE2 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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