Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms