Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ttc28Q80XJ3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ttc28Q80XJ3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ttc28Q80XJ3 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ttc28Q80XJ3 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ttc28Q80XJ3 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms