Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
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Dsg1bQ7TSF1 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Dsg1bQ7TSF1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Dsg1bQ7TSF1 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Dsg1bQ7TSF1 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Dsg1bQ7TSF1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Dsg1bQ7TSF1 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Dsg1bQ7TSF1 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Dsg1bQ7TSF1 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Dsg1bQ7TSF1 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Dsg1bQ7TSF1 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms