Protein–RNA interactions for Protein: Q6RT24

Cenpe, Centromere-associated protein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpeQ6RT24 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CenpeQ6RT24 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CenpeQ6RT24 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms