Protein–RNA interactions for Protein: Q64697

Ptprcap, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcapQ64697 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprcapQ64697 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprcapQ64697 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms