Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Fam220aQ3ZN08 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Fam220aQ3ZN08 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Fam220aQ3ZN08 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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