Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms