Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nhlrc4Q3UP44 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms