Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b2Q3UJB0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms