Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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