Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TraddQ3U0V2 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TraddQ3U0V2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms