Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms