Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Srsf6Q3TWW8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms