Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Usp39Q3TIX9 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Usp39Q3TIX9 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Usp39Q3TIX9 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Usp39Q3TIX9 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Usp39Q3TIX9 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Usp39Q3TIX9 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Usp39Q3TIX9 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Usp39Q3TIX9 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Usp39Q3TIX9 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Usp39Q3TIX9 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Usp39Q3TIX9 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Usp39Q3TIX9 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp39Q3TIX9 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Usp39Q3TIX9 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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