Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vps8Q0P5W1 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms