Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Cxcl5P50228 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Cxcl5P50228 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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