Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3aP47708 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3aP47708 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3aP47708 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3aP47708 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3aP47708 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3aP47708 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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