Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms