Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Tgfb1P04202 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Tgfb1P04202 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgfb1P04202 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgfb1P04202 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgfb1P04202 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgfb1P04202 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgfb1P04202 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgfb1P04202 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgfb1P04202 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgfb1P04202 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgfb1P04202 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgfb1P04202 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgfb1P04202 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgfb1P04202 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgfb1P04202 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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