Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Rab33bO35963 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Rab33bO35963 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Rab33bO35963 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Rab33bO35963 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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