Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Prrt1O35449 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Prrt1O35449 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Prrt1O35449 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Prrt1O35449 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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