Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Casq1O09165 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Casq1O09165 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Casq1O09165 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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