Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 1700006J14Rik-203ENSMUST00000160091 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcshO08795 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcshO08795 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrkcshO08795 Gm12758-201ENSMUST00000127010 4175 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Acot12-201ENSMUST00000022120 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Hnrnpk-221ENSMUST00000177497 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 4930552P12Rik-201ENSMUST00000181198 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Gm44510-201ENSMUST00000206288 4532 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Nfam1-202ENSMUST00000100377 2881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Wee2-201ENSMUST00000038907 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Foxp2-205ENSMUST00000115474 2544 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Decr1-201ENSMUST00000029877 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Retsat-201ENSMUST00000070597 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Tifab-202ENSMUST00000225063 2718 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Slc22a21-201ENSMUST00000076493 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Zfp60-208ENSMUST00000167955 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Rars-201ENSMUST00000018992 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Pknox1-201ENSMUST00000097352 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 AC117245.3-201ENSMUST00000217495 2176 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Rimbp2-202ENSMUST00000196085 3732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Gdpd1-201ENSMUST00000020804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Best3-201ENSMUST00000020378 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcshO08795 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms