Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Gm5225J3QPL3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Gm5225J3QPL3 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Gm5225J3QPL3 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm5225J3QPL3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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