Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 5330411J11Rik-201ENSMUST00000137162 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm13056-201ENSMUST00000142429 564 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Oprk1-201ENSMUST00000027038 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm23899-201ENSMUST00000158112 90 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 2810429I04Rik-204ENSMUST00000185835 923 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm9-201ENSMUST00000101636 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Epp13-201ENSMUST00000121024 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Slirp-202ENSMUST00000160488 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm5259-201ENSMUST00000191231 800 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm3945-201ENSMUST00000196637 683 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 AC165249.1-203ENSMUST00000219976 392 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Rassf6-205ENSMUST00000202704 1178 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gcn1E9PVA8 Gm44173-201ENSMUST00000204316 132 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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