Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Atp8b5A3FIN4 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Atp8b5A3FIN4 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Atp8b5A3FIN4 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Atp8b5A3FIN4 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atp8b5A3FIN4 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms