Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt16Q9Z2K1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt16Q9Z2K1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt16Q9Z2K1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt16Q9Z2K1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt16Q9Z2K1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt16Q9Z2K1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt16Q9Z2K1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt16Q9Z2K1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt16Q9Z2K1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt16Q9Z2K1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt16Q9Z2K1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt16Q9Z2K1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt16Q9Z2K1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt16Q9Z2K1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Krt16Q9Z2K1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krt16Q9Z2K1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krt16Q9Z2K1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt16Q9Z2K1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt16Q9Z2K1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 635.5 ms